Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms