Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRIP1Q9BX63 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms