Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FYCO1Q9BQS8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms