Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS8Q99627 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms