Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SAMD8Q96LT4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SAMD8Q96LT4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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