Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RNF185Q96GF1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms