Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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