Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEIL2Q969S2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms