Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS3Q969F9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms