Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTTNBP2Q8WZ74 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CTTNBP2Q8WZ74 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CTTNBP2Q8WZ74 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CTTNBP2Q8WZ74 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CTTNBP2Q8WZ74 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTTNBP2Q8WZ74 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms