Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms