Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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