Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNMB4Q86W47 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms