Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms