Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LRIG3Q6UXM1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRIG3Q6UXM1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms