Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HRCT1Q6UXD1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms