Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 APRT-205ENST00000564858 584 ntTSL 218.63■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 28.4
PRPF8Q6P2Q9 PPIL2-206ENST00000458567 557 ntTSL 44.23□□□□□ -1.735e-12■■■■■ 28.4
PRPF8Q6P2Q9 CCNC-214ENST00000523639 815 ntTSL 214.66□□□□□ -0.063e-11■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CCNC-202ENST00000369217 674 ntTSL 511.57□□□□□ -0.563e-11■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CCNC-211ENST00000521017 579 ntTSL 49.64□□□□□ -0.873e-11■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 SRRM1-222ENST00000596378 2314 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 PPIG-211ENST00000530152 690 ntTSL 39.25□□□□□ -0.936e-8■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 NPEPPS-224ENST00000534814 512 ntTSL 52.76□□□□□ -1.971e-8■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.688e-8■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 TULP3-202ENST00000448120 3076 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 TULP3-201ENST00000397132 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 ZNF148-210ENST00000497929 2381 ntTSL 52.97□□□□□ -1.939e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-10■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 RSRP1-204ENST00000473314 3034 ntTSL 210.75□□□□□ -0.692e-10■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 RSRP1-207ENST00000498238 2941 ntTSL 29.44□□□□□ -0.92e-10■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.424e-7■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 COG4-213ENST00000565715 575 ntTSL 28.03□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.446e-7■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 PICK1-214ENST00000484021 2531 ntTSL 216.78■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 BRWD1-210ENST00000446924 4990 ntTSL 22.69□□□□□ -1.982e-6■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 PSMA5-206ENST00000538610 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 SEPT2-226ENST00000461048 1163 ntTSL 1 (best)18.96■□□□□ 0.631e-20■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 515.45■□□□□ 0.064e-10■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.164e-10■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 213.2□□□□□ -0.34e-10■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.64e-10■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 417.66■□□□□ 0.423e-10■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 RNF31-205ENST00000557991 578 ntTSL 417.75■□□□□ 0.431e-12■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 RNF31-207ENST00000558634 537 ntTSL 413.25□□□□□ -0.291e-12■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 TMEM18-207ENST00000477202 1767 ntTSL 217.32■□□□□ 0.361e-11■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 TMEM18-205ENST00000432667 2572 ntTSL 511.02□□□□□ -0.651e-11■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.731e-11■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 TMEM18-202ENST00000355654 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-11■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.021e-11■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-204ENST00000517510 2016 ntTSL 59.7□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-207ENST00000518596 1047 ntTSL 29.47□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-221ENST00000521613 1903 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-205ENST00000517778 620 ntTSL 38.92□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-215ENST00000520015 1931 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-212ENST00000519646 2587 ntTSL 58.71□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-203ENST00000447740 5210 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.073e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-219ENST00000521415 1709 ntTSL 1 (best)7.9□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-213ENST00000519940 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-218ENST00000521092 555 ntTSL 27.63□□□□□ -1.193e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-222ENST00000522051 4680 ntTSL 27.4□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 28.3
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