Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms