Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms