Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDCA8Q53HL2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms