Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms