Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYTL3Q4VX76 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYTL3Q4VX76 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms