Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFX4Q33E94 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFX4Q33E94 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms