Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LETM2Q2VYF4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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