Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms