Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC142Q17RM4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC142Q17RM4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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