Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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