Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FSCN1Q16658 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms