Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF239Q16600 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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ZNF239Q16600 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
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ZNF239Q16600 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF239Q16600 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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ZNF239Q16600 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF239Q16600 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNF239Q16600 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNF239Q16600 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF239Q16600 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNF239Q16600 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF239Q16600 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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ZNF239Q16600 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNF239Q16600 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNF239Q16600 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNF239Q16600 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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ZNF239Q16600 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF239Q16600 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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