Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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