Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CST6Q15828 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CST6Q15828 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CST6Q15828 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CST6Q15828 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CST6Q15828 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CST6Q15828 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CST6Q15828 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms