Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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UBE3CQ15386 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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UBE3CQ15386 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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UBE3CQ15386 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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UBE3CQ15386 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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UBE3CQ15386 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE3CQ15386 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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