Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCA4Q14CN2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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