Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
BECN1Q14457 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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BECN1Q14457 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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BECN1Q14457 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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BECN1Q14457 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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BECN1Q14457 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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BECN1Q14457 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BECN1Q14457 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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