Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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