Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNIQ14094 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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