Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A3Q14050 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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