Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2H3Q13889 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms