Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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GTF2H2Q13888 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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GTF2H2Q13888 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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GTF2H2Q13888 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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GTF2H2Q13888 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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