Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOFQ13790 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOFQ13790 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOFQ13790 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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