Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCOA4Q13772 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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