Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TUBA3CQ13748 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TUBA3CQ13748 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TUBA3CQ13748 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TUBA3CQ13748 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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TUBA3CQ13748 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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