Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DNASE1L3Q13609 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DNASE1L3Q13609 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms