Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms