Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEUROD1Q13562 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEUROD1Q13562 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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