Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms