Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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FOXE3Q13461 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXE3Q13461 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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