Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
XRCC4Q13426 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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