Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PLD1Q13393 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLD1Q13393 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms