Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENBP1Q13228 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SELENBP1Q13228 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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